香瓜腐烂病主要危害果实和幼苗。幼苗受害时，叶片背面沿叶脉出现水渍状、暗绿色病斑，随后叶片卷缩、萎蔫，病斑变成黑褐色，严重时叶片干枯导致幼苗死亡。果实受害初期，病斑呈圆形或卵圆形、水渍状，逐渐扩大成不规则状，严重时病斑变成褐色并龟裂、腐烂，果实病部会出现白色泡沫状分泌物。叶片受害时，叶片上会出现浅褐色、圆形或沿叶脉分布呈多角形病斑，随后病斑变为红褐色，严重时叶片枯萎死亡。典型的果实病症是在甜瓜果实朝上的表面先出现水渍状小斑点，随后扩大成为大型橄榄色水渍状斑块。发病初期病变色仅限在果皮，果肉组织仍然正常，但严重影响甜瓜的商品价值。发病中期以后，病菌可单独或随同腐生菌蔓延到果肉，使果肉变成水渍状。发病后期受感染的果皮经常会龟裂，并因杂菌感染而向内部腐烂。有些品种果实受感染后，在果实上仅出现会龟裂的小褐斑，而无明显的橄榄色水渍状斑块，但病菌已侵入果肉组织，造成严重的水渍状病症。病斑上常有粘稠、褐色的菌脓溢出。接触地面的果面无病斑。瓜蔓、叶柄和根部通常不被侵染。病菌感染甜瓜子叶，造成水渍状病斑，病脉逐渐发展为黑褐色坏死病斑。随后感染真叶，在真叶上形成不明显的褐色小斑，周围有黄晕通常沿叶脉发展，对植株的直接影响不大，是感染果实的重要病菌来源。植株生长的健壮叶片上的病斑很少，通常不显著，暗褐色呈多角形，病叶很少脱落。开花后14-21天果实容易感染。果实上症状随甜瓜品种不同而各异。