黄瓜主要病害包括霜霉病、细菌性角斑病、疫病、黑星病、灰霉病、炭疽病、菌核病、靶斑病、镰刀菌枯萎病、蔓枯病、病毒病、猝倒病、立枯病、斑点病、白绢病、白粉病、红粉病、黑斑病、褐斑病、叶斑病、根腐病、细菌性缘枯病、细菌性叶枯病、根结线虫病、根腐线虫病以及生理病害、药害、肥害、气害。主要虫害有美洲斑潜蝇、瓜蚜、温室白粉虱、烟粉虱、红蜘蛛、地老虎、蛴螬、黄足黄守瓜、黄足黑守瓜、瓜绢螟、葫芦夜蛾、瓜实蝇、棕榈蓟马、黄蓟马、绿盲、红脊长、朱砂叶螨、二斑叶螨等。常见的病虫害有霜霉病、灰霉病、白粉病、角斑病、蚜虫、白粉虱、小菜蛾等。