选用良种：目前种植较多的日本夷香南瓜、锦栗南瓜、桔红南瓜有一定的抗病性，但要做好提纯复壮工作，选用无病种苗。种子消毒：播前先在阳光下晒种1～2天，以杀灭表皮杂菌，提高发芽势。用50～55℃温水搅拌浸种30分钟，温度降低到30℃继续浸种8～10小时，再放入1%高锰酸钾溶液消毒20～30分钟，冲净后在28～30℃下催芽48～72小时，露白时播种。
南瓜白粉病是由瓜类单丝壳引起、发生在南瓜上的病害。主要为害叶片。苗期、成株期均可发病。植株生长后期受害重，果实受害少，初在叶片或嫩茎上出现白色小霉点，后扩大为1-2厘米霉班，条件适宜，霉斑迅速扩大，且彼此连片，白粉状物布满整个叶片，致叶片黄枯或卷缩，但不脱落，秋末霉斑变成灰色，其上长出黑色小粒点，即病原菌闭囊壳。
化学防治：病害发生前可选用53.8%可杀得2000型1000倍液，或发病初期用10%世高1500倍液，或40%福星3000倍液，或72%普力克3000倍液，或12.5%速保利2000倍液。4月下旬-7月适时用药防治，发病初期可选用10%苯醚甲环唑1500倍液，或40%氟硅唑8000倍液，也可采用小苏打600倍液防治，在个别叶片有1-2个病斑时开始喷雾，每3-4天喷1次，连续喷4/6次。小苏打既能防病害，又能促进生长，且使南瓜产量提高10-20%。喷雾时尽量使用小孔径喷片，以降低叶片表面湿度。