水稻基腐病的发病条件包括低温、多雨和偏施氮肥等。该病主要通过水稻根部和茎基部的伤口侵入,在发生洪灾或台风后,尤其是在高温高湿环境下更易发病。南方地区5-7月雨水多,易发水灾,8-9月台风频繁,因此早稻穗期、中稻分蘖期、晚稻穗期病害易发。偏施氮肥、水稻贪青、光照不足、低洼地等条件也易导致病害加重。一般常规稻较杂交稻发病多,粳稻较籼稻发病重。病害的发生与气候、品种、栽培管理等因素密切相关。