菠菜黑斑病由真菌侵染所致，病菌以菌丝或分生孢子在种子或病残体上越冬。翌年春天，附着在种子上的分生孢子或潜伏在种皮内的菌丝形成分生孢子，借气流、雨水及农事操作传播，在适宜条件下经气孔、伤口或直接穿透表皮侵入进行初侵染和再侵染。多雨年份或田间湿度高利于发病。气温10℃左右，空气相对湿度85%以上，昼夜温差大和多雨潮湿的天气易发病。通风不良、田间积水、过早播种、密度过大的地块发病重。
