在冬麦区，病菌在小麦残体上或种子上越夏，秋季开始侵入幼苗，以菌丝体在病株上越冬。来年春季，病菌产生分生孢子传播为害；在春麦区，病菌的分生孢子器及菌丝体在小麦残体上越冬，来年春季小麦播种后产生分生孢子传播为害。在低温多湿的条件下有利于此病的发生扩展。品种间对叶枯病的抗病性差异较大。小麦叶枯病的发病规律是病菌多以菌丝体潜伏在种子内或以孢子附着在种子表面，或以菌丝、分生孢子器、子囊壳在病残体中越夏或越冬。种子和田间病残体上的病菌为苗期的主要初侵染来源。
