西葫芦绵腐病属真菌性病害。病菌在基质中越冬，通过茎、叶和果实表皮侵入植株，借助雨水、灌溉或管理操作等进行传播。种子本身带病，土壤带病，水流传播，空气传播。以卵孢子在土壤中越冬，适宜条件下萌发，产生孢子囊和游动孢子，或直接长出芽管侵入寄主。后在病残体上产生孢子囊及游动孢子，借雨水或灌溉水传播，侵害果实，最后又在病组织里形成卵孢子越冬。病原主要分布在表土层内，雨后或湿度大，病原迅速增加。在基质温度低、湿度大的条件下最易发病。在发病初期及时用药防治，药剂可用：75%百菌清可湿性粉剂800倍液、或25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液、或14%络氨铜水剂300倍液、或72.2%普力克水剂400倍液，重点喷洒到植株下部果实和地面，7~10天一次，连喷2~3次。