选用优良抗病品种，对种子对行包衣，实行轮作，地膜覆盖，配方施肥，药剂防治。
小麦炭疽病在湿度大、温度高的条件下容易发病，因此在种植时选用抗炭疽病的小麦品种，并实行轮作。发病后及时使用苯菌灵可湿性粉剂或苯菌灵乳油等药剂进行防治，并在15天后再用药一次。
