辣椒青枯病的防治方法主要包括农业防治和药剂防治。农业防治方面，首先在种子育苗时进行种子消毒，其次改种植方式为起垄种植，并实行轮作，以降低土壤含菌量，减轻病害发生。同时，改良土壤，优化栽培方式，采用高垄或半高垄栽培，配套田间沟系，降低田间湿度，增施磷、钙、钾肥料，促进作物生长健壮，提高抗病能力。雨天及时排涝，避免高温高湿传播途径。药剂防治应在发病初期施药，可选用72%农用链霉素4000倍液、77%氢氧化铜可湿性粉剂500倍液、50%代森锌可湿性粉剂1000倍液、50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液等药剂灌根，每株灌药液0.5升，每10天1次，连灌3～4次。病株严重时及时灌根或拔除。