辣椒栽培中常见的病虫害包括根腐病、立枯病、猝倒病、霜霉病、灰霉病、菌核病、褐斑病、白粉病、叶霉病、溃疡病、疫病、青枯病、炭疽病、病毒病、地老虎、蛴螬、白粉虱、蚜虫、斑潜蝇、红蜘蛛、蓟马和斜纹夜蛾等。其中，青枯病和白粉病是辣椒常见的病害。青枯病主要侵害叶片，导致植株枯萎，可用农用链霉素、春雷霉素防治。白粉病会使叶片出现白色粉状物，正面有黄色斑点，需用多氧清、杜邦福星和新高脂膜喷洒。常见的虫害有蚜虫、白粉虱和棉铃虫。蚜虫吸食茎叶养分，白粉虱侵害嫩茎，棉铃虫主要侵害花朵和果实。
