芹菜常见的病虫害有菌核病、病毒病、空心、叶柄开裂及缺硼、根腐病、软腐病、斑枯病、叶斑病。常见的虫害有蚜虫、斑潜蝇、菜蛾、跳甲类等。前期种植的时候尽量选择抗病性较强的品种；播种前用48度的温水把种子泡半小时；后期发现病体及时清除，注意空气的流通性；可用药物喷剂预防与治愈。常见的虫害主要有蚜虫、斑潜蝇、菜蛾、跳甲类等，可用吡虫啉、蚜螨虫威、斑潜净等药物喷剂除杀。
