菠菜炭疽病是由半知菌亚门菠菜刺盘孢真菌侵染引起的。病菌以菌丝体在病残体组织内或附在种子上越冬，成为第二年的初侵染源。春天环境条件适宜时，越冬病菌产生的分生孢子通过风、雨、昆虫等传播，从伤口或直接穿透表皮侵入，植株发病后又产生分生孢子盘和分生孢子，进行扩散再侵染。
适合病菌生长的温度是24―29℃，高于34℃或低于5℃则病菌停止生长。在25℃左右，相对湿度达90％以上时，发病严重。若湿度降低到80％以下，则不利于病害发生，当湿度降到54％以下时，炭疽病不发生。下雨多、浇水多、地势低洼、排水不良、湿度大，发病严重。保护地菠菜不放风或放风不及时，湿度大，结露时间又长，发病重；重茬地、发病重；种植过密、偏施氮肥、植株生长不良，发病也重。年度间秋季高温多雨的年份发病重；田块间地势低洼、地面潮湿的田块发病早且重；栽培上反季节栽培、播种早、种植密度过大、通风不良、植株生长发育不健壮的发病重。