草莓根腐病是一种真菌性病害，主要通过药剂灌根的方法进行防治。建议使用恶霉灵、咯菌腈或络氨铜等铜制剂进行灌根，并结合叶面喷雾咯菌腈或春雷霉素等药剂，同时添加叶面肥以补充作物能量。此病害以灌根防治为主，叶面喷雾为辅，因为得病后作物传导输送水肥能力差。最佳预防措施是在定植当天使用络氨铜等铜制剂进行灌根。
发病初期，应立即使用根康灵50毫升加沝肥郎50毫升兑水15千克进行均匀灌根，3天一次，连用两三次；同时叶片每7-10天喷施一次1000倍菜四快。病情控制后，转为预防。发病中期，使用根康灵200毫升加沝肥郎50毫升兑水15千克进行均匀灌根，3天一次，连用两三次。病情控制后，转为预防。
此外，应选无病地育苗，栽培抗病品种，有条件的实行4年以上间隔轮作。施用腐熟的有机肥，避免偏施氮肥；高垄栽培，覆盖地膜，有利于提高地温，减少湿度，防止根腐病的发生。对发生根腐病的草莓，应及时挖出病株。雨后及时排水，严禁大水漫灌。
草莓根腐病的防治方法以预防为主，采用根康灵喷雾和灌根，并结合新型水溶肥沝肥郎和菜四快叶面喷施，可以基本控制住草莓根腐病的危害。