硅肥在水稻上可做底肥或追肥。底肥施用时可与稻草、农家肥及绿肥等有机肥一起施入,翻地时将硅肥与有机肥混合,既能加速稻草等有机肥的分解,又能提高硅肥的有效性。追肥可在移栽后一周内随撒除草剂一起施用,有些硅肥也可叶面喷雾。