韭菜根蛆的防治可以采用高效氟氰菊脂加敌百虫对根部喷雾，同时注意安全间隔期。此外，阿维菌素或毒死蜱颗粒剂也可以撒施根部，或者使用低毒适量的敌百虫灌根。为了减少土壤中的幼虫，实施2年以上的轮作是一个有效的方法。在施肥方面，建议多施腐熟的有机肥，但要避免施用未经腐熟的有机肥，以防带来病菌，增加病害防治的难度。
