小麦条锈病主要危害叶片、茎秆和麦穗。发病初期,叶片由褪绿绿色发展为鲜黄色疱斑或黑色疱斑。在旗叶、穗部和顶部秸秆部位,会出现不同程度的条斑状黄褐色孢子霉层。受害部位失绿,形成黄色斑点或疱斑。小麦苗期受害时,叶片上产生鲜黄色斑点;成株期刚发病时,叶片正面形成很多鲜黄色的夏孢子堆,后期叶片表皮破裂,出现锈色粉状物,最终导致叶片干枯死亡。