气候冷凉,湿度高时田间发病重。在中国南方,一般在早春阴湿的天气出现。贮藏期间,高湿常使病害迅速蔓延,对胡萝卜菌核病来说,贮藏期间的扩展蔓延比入窖(库)时的菌源影响更大。肉质根冻伤、擦伤是病害在窖库中大爆发的诱因。子囊孢子在侵染循环中不起作用,以菌丝体为初侵染源,病健株接触构成再侵染。低温、湿度大易发病。