（1）种子消毒。用35％恶苗灵水剂对水稀释250倍液；或45％901可湿性粉剂稀释500倍液，一浸到底。（2）农业措施。选用无病无伤种子；不用病稻草盖种催芽或捆秧；避免烈日下拨秧、不插隔夜秧；移栽时剔除病苗，及时拔除田间病株深埋。目前防治水稻恶苗病，主要是靠药剂处理种子，药剂可以选用二硫氰基甲烷，或者是氰烯菌酯。在田间出现症状时可用恶霉灵进行防治，同时应拔除病苗烧毁减少二次感染。
