肉质根发病后，组织软化，呈水浸状褐色软腐，腐烂后有臭味，有汁液流出。地上部叶片萎蔫。防治方法：选择无病株留种，与禾本科作物实行3年以上的轮作，并加强水肥管理，提高胡萝卜抗病能力，发病初期可用农用链霉素0.02%水溶液，或敌克松原粉500~1000倍液喷雾防治，每隔10天喷一次，连续喷2-3次，注意均匀用药。
胡萝卜菌核病发病初期，肉质根表面产生污垢状斑点，随着病程延长斑点扩展成不规则形、水浸状、褐色病斑。病斑多在肉质根的上半部出现，向上扩展至叶柄基部，使叶柄基部呈褐色立枯状。空气湿度较大时，病斑上出现污白色蛛丝状菌丝，病斑也软化腐烂。胡萝卜生育期发病，植株地下肉质根受害，顶部或向阳面初现水渍状斑，后期变成褐色湿腐，稍凹陷。病斑表面长出白色菌丝体，后期形成不规则菌核，继而肉质根软化、腐烂。潮湿环境下，肉质根表面出现白色绵状菌丝体和鼠粪状菌核。贮藏期胡萝卜菌核病可继续发生，造成烂窖。
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