芝麻青枯病是一种严重危害芝麻植株的病害，主要影响蒴果、叶和茎秆，尤其在高温高湿的7-8月份发病严重。当田地温度达到13℃时，青枯病菌开始侵染，温度升至25-45℃时，病情加剧。病株率在5%至40%之间。
芝麻植株感染后，茎秆上首先出现暗绿色斑块，随后变为黑褐色条斑，顶梢可能出现梭形溃疡状裂缝。初期，植株顶端萎蔫，随后下部叶片也出现萎凋，呈现失水状。剖开根茎可见维管束变褐，逐渐蔓延至髓部形成空洞，湿度大时会有菌脓溢出，形成漆黑色晶亮的颗粒，病根变褐，细根腐烂。
叶片感染后，叶脉出现墨绿色条斑，纵横交叉呈网状，对光观察呈透明油浸状，叶背脉纹呈黄色波浪形扭曲突起，后病叶褶皱或变褐枯死。蒴果初期呈水浸状病斑，后变为深褐色条斑，蒴果瘦瘪，种子小不能发芽。
芝麻青枯病，又称芝麻瘟，发病后全株迅速萎蔫枯死，蒴果不能成熟，对产量损失极大。该病害能够危害芝麻整个植株，从根部、叶片到蒴果都会受到青枯病的危害。茎部初期出现绿色病斑，后期变为黑色条状病斑，茎内外有菌胶溢出，最后变成黑色颗粒。叶片初期叶脉上有墨绿色条斑，纵横交错分布，中心位置呈油渍状，后期叶片萎蔫程度增加，植株慢慢枯萎而死。蒴果初期出现水渍状病斑，颜色变成深褐色，后期病斑变成条斑，导致蒴果瘦小，籽粒不饱满，影响品质和产量。芝麻青枯病的特征还包括白天凋萎，夜晚复生，几天之后植株带绿枯死。