大蒜软腐病是细菌性侵染病害，病原物是胡萝卜软腐欧氏杆菌，主要通过土壤中病残体上的病原物进行再侵染。秋播大蒜从11月开始发病，田间地势低洼、降雨及浇水多、排水不良、田间湿度大处发病重，阴沟阳畦方式栽培的发病重，抗寒性差的大蒜品种发病重。本病播种过早及施化肥过多而年前生长过旺的发病重。
发病规律病菌主要在土壤中尚未腐烂的病残体上存活越冬，条件适宜后侵染大蒜，引起大蒜软腐。干旱时可自行缓解，对产量有明显影响。病菌喜高温、潮湿环境，发病最适宜气候条件为温度25～30℃，土壤含水量高、田间湿度大有利于发病。浙江及长江中下游地区大蒜细菌性软腐病的主要发病盛期在5～6月。大蒜细菌性软腐病的感病生育期在大蒜生长后期。连作、地势低洼、排水不良、生长过旺的田块发病重；年度间雨水多的年份危害严重。
大蒜种植应注意及时预防虫害与加强田间管理工作，加强田间管理和水肥管理，及时喷洒药物预防。