稻曲病仅发生在水稻穗部，为害单个谷粒，少则1-2粒，多至十余粒。受害谷粒在内外颖处先裂开，露出淡黄色块状物，逐渐膨大包裹内外颍两侧，呈孢子球。孢子球开始很小，逐渐膨大，稍扁平，光滑，外覆盖一层薄膜，随着孢子球膨大而破裂。颜色逐渐变为黄绿色至墨绿色，老面平滑，最后龟裂，散出圈绿色粉末，即病原菌的厚垣孢子。有的孢子球两侧生黑色扁平菌核，风吹雨打易脱落。
