芹菜灰霉病由半知菌亚门葡萄孢菌属真菌侵染引起。病菌以菌核或分生孢子在土壤中或病残体内越冬，借气流、雨水传播蔓延。每次收韭菜都会把病菌散落于土表，致新生叶染病。灰霉病的发生与温湿度关系密切，湿度大利于发病。秋末冬初韭菜扣棚后始见发病，生态条件适合病情不断加重。
在适宜环境条件下，菌核萌发出菌丝体并产生分生孢子梗及分生孢子，借气流传播至寄主作物上，从寄主伤口、衰弱及坏死组织部位侵入，引起初次侵染。病菌侵入后迅速蔓延扩展，并在病部产生新生代分生孢子，借气流传播进行多次再侵染。后期形成菌核后越冬。
该病主要以菌核在土壤中或在病残体上越冬或越夏。条件适宜时病原借气流、雨水、露珠及农事操作传播，进行初侵染和再侵染。从植株伤口或衰老的器官及枯死的组织上侵入。分生孢子成熟后脱落，借气流、雨水或露珠及农事操作进行传播，萌发时产出芽管，从寄主伤口或衰老的器官及枯死的组织上侵入，发病后在病部又产生分生孢子，借气流传播进行再侵染。