病毒病可通过农事操作、传毒昆虫、植株间摩擦等交叉接触感染，传染迅速，寄主范围广。在高温干旱强日照条件下病毒病发病较重。蚜虫是病毒病的主要传播媒介。田间农事操作如间苗、定苗、整枝、打权、摘心等都能传播，使病害扩大蔓延。土质黏性重，板结，土壤瘠薄，施肥不足，或施用未腐熟有机肥，偏施氮肥，缺磷钾肥，植株长势弱或徒长，田间杂草多，以及连作地发病重。
防治方法包括减少菌源，不可偏施氮肥，增施磷钾肥，合理密植，合理灌水，浅水勤灌，适度晒田，降低田间湿度。在封行至成熟前喷施药物，每亩水稻用井冈霉素2包，兑水45公斤喷雾防治；或者用75%稻曲纹枯灵可湿性粉剂亩用40克，兑水45公斤喷雾防治；同时可以采用30%洁苗乳油20毫升兑水45公斤喷雾防治。
选用抗病优良品种，加强肥水管理，综合防治南瓜病毒病。南瓜病毒病发病原因是重茬种植，种子选育和杀菌不严格，没有及时防治病虫害。南瓜病毒病是由蚜虫、蓟蚂、粉虱等昆虫媒体带毒传播所导致。加强田间管理：适时播种，合理肥水，培育壮苗。农事操作中，接触过病株的手用洗消毒液后再进行农事操作，防止接触传染。发病原因露地栽培者一般从6月开始发病，高温干燥条件下易发病。