芹菜病毒病主要危害叶片，使心叶表现为明脉，脉间黄化和叶片斑驳，引起幼嫩叶柄向外和向下卷曲，致使植株向四周呈倒伏状散开。叶片上会出现黄绿相间的斑驳，并呈皱缩状，严重时叶片变窄，扭曲畸形，后成褐色枯死斑。也可出现边缘明显的黄色或淡绿色环形放射状病斑，并在整个叶片上散生许多小点。病叶皱缩，向上卷曲，新叶停止生长。全株缩小，叶片变细，成丛生状。
此病是由病毒侵染引起的系统性病害，从苗期至成株期均可发病，全株受害。染病株发病初始表现为在叶片皱缩，呈现浓、淡绿色斑驳或黄色斑块症状的明显黄斑花叶，叶色褪绿，叶面皱曲，新生叶片偏小，有的叶片扭曲、变窄，叶柄纤细。发病严重时，心叶节间缩短，全株叶片皱缩，停止生长或黄化、矮缩。发病晚的多见于所生叶呈浓、淡绿相间的花叶，植株正常。
芹菜从苗期至成株期均可发病。苗期发病出现黄色花叶或系统花叶，发病早的所生嫩叶上出现斑驳或呈花叶状，病叶小，有的扭曲或叶片变窄；叶柄纤细，植株矮化。成株期发病，病后表现的症状有叶片变色黄化，畸变，植株矮化等。发通常叶片症状与植株矮化复合出现，以叶畸变引起的植株矮化最为严重。
芹菜病毒病是系统性病害，病症主要表现在植株上部叶片。花叶型病症：发病初始表现为在叶片上出现黄绿相间、叶色深浅相间的花叶症状。斑驳矮缩型病症：病株的叶片处现浓、淡绿色不均的斑驳花叶，或叶内全部褪绿，叶面皱曲，新生叶片偏小。发病严重时，心叶节间缩短，叶片皱缩，并使植株黄化、矮缩。病毒病苗期开始发病，叶片初期呈现浓、淡绿色斑驳或黄色斑块，表现为明显的黄斑花叶，后变为褐色的坏死斑，也可出现边缘明显的黄色或淡绿色环形放射状病斑，严重时心叶扭曲畸形或全株叶片皱缩不长、黄化、矮缩，叶柄扭曲，全株矮化，甚至死亡。