在马铃薯开花前后，田间发现中心病株后，立即拔出深埋，并喷洒药剂进行防治。可使用克露100克/亩全田均匀喷洒，进行预防保护性防治，用抑快净每亩40克喷雾施药，间隔期为5－10天施要一次；正常天气条件下间隔7-10天用药，25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液，或用65%代森锌可湿性粉剂500倍液，64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液，40%乙磷铝可湿性粉剂500倍液，75%百菌清可湿性粉剂600-800倍液喷雾。间隔7-10天喷药1次，连续喷药2-3次。如干旱少雨，喷药间隔天数，可适当延长。在高湿多雨条件下，应间隔5-7天用药一次，根据病情发生风险的大小可适当调整用药次数。
各地应根据当地特点选用适合种植的抗病丰产良种，建立无病留种田，选种无病种薯，做到秋收入窖，冬贮查窖，播前切块，春化过程中，每步程序均严格剔除病薯，避免病薯下地，减少初侵染源。适时早播，选择土质疏松、排水良好地块，合理施肥，保持植株健壮，增强抗性。发现中心病株，及时拔除销毁。
病原菌以菌丝体在种薯中越冬，或以厚壁卵孢子在土壤中越冬，翌年春天当带菌种薯萌芽时，病菌开始活动向地上茎叶发展，成为中心病株，土壤中的厚壁卵孢子通过芽管萌发产生孢子囊开始侵染植物，病株上的孢子囊经气流传播进行再侵染，雨天孢子囊随雨水进入土壤后，通过伤口、皮孔和芽眼侵入块茎，以菌丝体在块茎中越冬，带病的薯块再次成为第二年晚疫病的发病源，造成恶性循环。
选土质疏松、排水良好的田块栽植，促进植株健壮生长，增强抗病力，开花前后加强田间调查，一旦发现中心病株，立即拔除，并摘除附近植株上的病叶，就地深埋，撤上石灰。
马铃薯晚疫病是一种真菌病害，气温在10℃以上，空气湿度85%以上即可发病。防治措施，一是播种前土壤消毒。二是种块处理。三是控制徒长，保证通风。四是及时处理中心病株。五用68%霜霉威悬浮剂1000倍液，50%烯酰吗啉可湿性粉剂1500倍液防治。
要以防为主，在马铃薯幼苗期，必须每10—15天叶面喷洒一次800倍50%多菌灵可湿性粉剂水溶液，或1000倍50%苯菌灵可湿性粉剂水溶液，或1000倍50%异菌脲可湿性粉剂水溶液，或800倍80%百菌清可湿性粉剂水溶液，或800倍80%代森锰锌可湿性粉剂水溶液进行预防，连续喷洒2—3次。发病后连续喷洒2—3次1500倍10%苯醚甲环唑水分散剂水溶液，或3000倍50%咯菌腈可湿性粉剂水溶液，或1500倍25%嘧菌酯悬浮剂水溶液进行防治，每7—10天喷洒一次，均匀喷湿所有的叶片，以开始有水珠往下滴为。
选用无病种薯，减少初侵染源。做到秋收入窖、冬藏查窖、出窖、切块、春化等过程中，每次都要严格剔除病薯，有条件的要建立无病留种地，进行无病留种。加强栽培管理，适期早播，选土质疏松、排水良好的田块栽植，降低田间湿度，促进植株健壮生长，增强抗病力。
马铃薯晚疫的防治措施：选用内吸治疗剂。72%霜脲锰锌（克露或美单）可湿性粉剂500-700倍液；或64%恶霜锰锌（杀毒矾）可湿性粉剂400-500倍液；或烯酰.乙磷铝可湿性粉剂400-500倍液，全田喷施。根据发病程度，每隔7天喷药一次，连喷3-4次，不同药剂交替喷施，以免病菌产生抗药性。
马铃薯晚疫病防治措施：选择保护性药剂和治疗性药剂混合使用，合理安排间隔期。保护性药剂：丙森锌、代森联、代森锰锌、噻唑锌、王铜、氢氧化铜。治疗性药剂：氟菌·霜霉威、霜脲·锰锌、烯酰吗啉、氟啶胺等。
在晚疫病发生初期，要及时清除病株，并进行第一次喷药，以后根据具体情况，7-10天喷药一次，一连喷2次。药剂可选择58％甲霜灵锰锌、64％杀毒矾、代森锰锌、72％克露或69％安克锰锌等。