西瓜空心的原因主要包括气候、水分和采收时间。在干旱或低温条件下，西瓜内部养分供应不足，导致种子周围不能自然膨大，细胞分裂速度变慢，果实内细胞数量不足，形成横断空心果。果实膨大期严重缺水或成熟期浇水过多，都会导致果实发育不均衡，形成空心果。此外，成熟后不及时采收，营养物质和水分的倒流也会导致空心果的形成。
