水稻缺磷时，植株生长缓慢，矮小，茎叶细狭，叶片直挺，呈“一炷香”株型，分蘖显著减少或不分蘖。叶色深暗，呈暗绿或灰蓝色，叶尖及叶缘常带紫红色，叶片无光泽。出穗和成熟延迟。缺磷常在生育前期形成僵苗，表现为生长缓慢，不分蘖或延迟分蘖，秧苗细弱不发根。叶色暗绿或灰绿带紫色，叶形狭长，叶片小，呈环状卷曲。老根变黄，新根少而纤细，严重时变黑腐烂。成熟期不一致，穗小粒少，千粒重低，空壳率高。还易引起胡麻叶斑病；抽穗、成熟延迟，减产严重。新叶中脉及其两侧叶片基部首先褪绿、黄化，有的连叶鞘脊部也黄化，以后逐渐变为棕红色条斑，有的出现大量紫褐色小斑，遍布全叶，植株通常有不同程度的矮缩，老叶叶鞘甚至高于新叶叶鞘，称为倒缩苗或缩苗。拔节困难，分蘖松散呈草丛状，成熟延迟，虽能抽出纤细稻穗，大多不实。