火龙果着色差的原因主要有以下几点：
1.留果过多：为了提高产量，果农常不进行疏果管理，导致果实营养分配不均，出现转色不完全的现象。
2.光照不足：转色至着色阶段，火龙果需要充足的光照。光照不足会影响光合作用，导致光合物质积累不足，影响果实上色。
3.水分管理不当：转色期需水量增加，但果园积水或土壤过湿会影响根部呼吸，进而影响营养吸收和果实着色。
4.营养不均衡：过量施用氮肥会导致火龙果返青，影响着色。应合理施用有机无机复混肥和叶面肥，促进果实着色。
5.温度影响：低温弱光会影响花粉发育和授粉，导致落花落果，同时减弱光合作用，影响营养供应和果实上色。
6.土壤问题：长期不合理使用化肥导致土壤板结、盐碱化，影响果树营养吸收和转化，进而影响果实着色。