胡萝卜黑腐病在高湿环境下易发，生长期间多雨和土壤潮湿会增加黑腐的发生率。贮运期间，湿度大也会导致腐烂严重。肉质根膨大期，地下害虫的危害严重，造成的伤口多，易引发病害。在种子生产田中，黑腐病的发病率可达35%以上，越冬窖藏母根的常年发病率约为30%，烂根率超过10%。黑腐病的发生不仅威胁母根生产，还增加了制种成本，严重影响胡萝卜制种业的可持续发展。病害的适温为17℃，最适酸碱度为pH6.6。病菌在水中可存活1个月，在土中存活3个月，在土表存活1年。通常在白菜生长中后期或反季节栽培时，遇连阴雨天气，该病易发生和流行。