辣椒疫病在苗期和成株期均可发生，以成株期为主。病菌可侵染根、茎、叶、果。苗期发病表现为茎基部呈暗绿色水浸状软腐或猝倒，即苗期猝倒病；有的茎基部呈黑褐色，幼苗枯萎而死。成株期叶片发病多在叶缘和叶柄连接处出现不规则暗绿色病斑，水渍状，边缘为黄绿色，多雨高湿条件下发展迅速，常造成叶片腐烂，干燥条件下病斑干枯易破碎。茎基部和茎节分杈处发生成段暗绿色病斑，水渍状，后出现环绕表皮扩展的暗褐色或黑褐色条斑，病部易缢缩折倒，病部以上茎梗也易凋萎死亡。果实受害多从蒂部开始，病斑呈暗绿色水渍状软腐，边缘不明显，很快扩展到全果实，引起腐烂，潮湿时病部覆盖白色霉层，干燥后形成暗褐色僵果。