空心病关键在于预防，特别是在育苗期。一旦发病，即便使用大量药剂也难以控制，因为没有特效药。防治措施包括轮换使用铜制剂、氯溴异氰尿酸、中生菌素、四霉素、春雷霉素和噻霉酮等药剂，必要时可以两种药剂复配。对于腐烂病和黑斑病，建议将受损部分剪除，并喷洒30%托布津可湿性粉剂500倍液。如果发现飞燕草受到虫害，则应喷洒10%除虫精乳油2000倍液进行除虫。
