被危害的植株表现为幼虫钻蛀于葱心叶和叶鞘上蛀食叶肉和表皮,形成灰白色不规则蜿蜒潜道,幼虫在潜道中钻行于葱叶各处,危害叶脉,严重时会导致大葱地上部干枯死亡。葱潜叶蝇以幼虫在叶片组织中潜食叶肉,形成迂回曲折虫道,呈曲线状或乱麻状,被害处仅剩上下表皮,严重时可使全叶枯萎,产量下降。