大豆根腐病主要发生在幼苗期，病株的根部和茎基部会形成褐色椭圆形或长条形病斑，后期根部变黑褐色，表皮腐烂。病株通常矮黄，下部叶片提早脱落，一般不枯死，但结荚少、豆粒小。病害主要影响大豆根部，无论是幼苗还是成株都可能感染。初期，茎基部或胚根表皮出现淡红褐色不规则小斑，随后变为红褐色凹陷坏死斑，绕根茎扩展导致根皮枯死。受害株的根系不发达，根瘤少，地上部矮小瘦弱，叶色淡绿，分枝和结荚明显减少。
