称芹菜茎点霉，属半知菌亚门真菌。幼嫩菌丝初无色，老熟后长成黑色，在马铃薯琼脂培养基上能产生小菌核。分生孢子器球形或半球形，黑色，初埋生后外露，多在不明显的斑点中形成；分生孢子器上具孔口，产孢细胞多单细胞，产孢方式为瓶梗式别于叶点霉菌。分生孢子单胞无色，长椭圆形，大小3．0～3．8×1．0～1．6微米。病菌生长发育和分生孢子萌发温限5～30℃，16～18℃最适。
黑腐病的病菌会以病菌孢子及菌丝等各种形态潜伏在病残体及土壤中进行越冬。然后在第二年春季环境适宜时，病菌便会开始活动。然后借助风、雨水、土壤等各种介质进行传播。黑腐病病菌分生孢子会从芹菜的芽管入侵，导致病部表皮受害，引发黑腐病，移栽苗的发病情况最为严重。
芹菜黑腐病病因。主要以菌丝附在病残体或种子上越冬。翌年播种带病的种子，长出幼苗即猝倒枯死，病部产生分生孢子借风雨或灌溉水传播，孢子萌发后产生芽管从寄主表皮侵入进行再侵染，生产上移栽病苗易引起该病流行。
芹菜黑腐病病菌通过气流雨水传播。1、土壤原因。可能是由于土壤中缺钙，不能满足芹菜对钙元素的需求；也可能是土壤不缺钙，但由于耕作土层呈酸性，影响了芹菜对钙元素的吸收，因而发生黑心病。2、施用化肥不合理。一般在氮肥或钾肥施用过多的情况下，即使土壤中不缺钙，也会影响植株对钙元素的吸收而出现黑心病。3、土壤干旱。4、气候因素。
属于半知菌亚门真菌，主要以菌丝附在病残体或种子上越冬。翌年播种带病的种子，长出幼苗即猝倒枯死，病部产生分生孢子借风雨或灌溉水传播，孢子萌发后产生芽管从寄主表皮侵入进行再侵染，生产上移栽病苗易引起该病流行。