西葫芦的底肥主要以腐熟有机肥为主，且量要充足。在整好地块后，浇适量水分，然后根据肥力需求撒入腐熟的有机肥、二铵、尿素、硫酸钾或硝酸钾。施肥时要注意温度，避免肥料浓度过高导致西葫芦烂根。一般每亩施腐熟的有机肥2000公斤、饼肥75公斤、复合肥40公斤、草木灰80公斤，将肥料均匀撒于地面，深翻30厘米，整平地面即可。
在种植葫芦时，通常使用有机肥料，因其营养全面，肥效稳定，可穴施或条施。缓苗后，随水冲施尿素，后控水蹲苗。在结瓜期，需平衡施肥，当根瓜开始膨大时结合浇水进行第二次追肥，每亩追施尿素15-20公斤或氮磷钾复合肥10-15公斤。灌水后封严地膜加强放风排湿。
苦瓜植株有特殊气味，抗病虫能力较强，但高温多雨季节常发生炭疽病、褐斑病；可用70%的甲基托布津800-1000倍液或75%的百菌清800倍液喷雾防治。