病菌主要以菌核在土壤中及混杂在种子中越冬或越夏，在环境条件适宜时，菌核萌发产生子囊盘，子囊盘散放出的子囊孢子借气流传播蔓延，穿过寄主表皮角质层直接侵入，引起初次侵染。
病菌主要以菌核在土壤中及混杂在种子中越冬或越夏,环境条件适宜时,菌核萌发产生子囊盘,子囊盘散放出的子囊孢子借气流传播蔓延,穿过寄主表皮角质层直接侵入,引起初次侵染。病菌通过病、健株间的接触进行多次再侵染,加重危害。病菌对温度要求不严格,子囊孢子在10~30℃均可萌发,适宜湿度为85%以上。棚内低温高湿,茄子菌核病发病较重。病株与健株、病枝与健枝接触,或病花、病果软腐后落在植株健部均可诱发病害,成为再侵染的一个途径。