南瓜白粉病的发生与多种因素有关。田块间连作地、附近有发病较重的菌源田、排水不良、作物生长势不佳的发病较早较重。高温干旱环境条件下，植株长势弱、密度大时发病重。白粉病始发期在5月下旬至6月上旬，此期气温适宜，早晨露水多，田间湿度大，有利于南瓜白粉病发生。南瓜白粉病在高温高湿与高温干燥交替出现时发病达到高峰，同时在尿素等氮肥施用较多、种植过密、潮湿的田块容易发病或发病较重。生产结束后病菌在老株和病残体上越冬。
