桉树灰霉病主要侵染桉苗的叶片、嫩梢和幼茎。病部组织初期呈浅褐色，水渍状软腐，后期溃烂。叶片病斑大小约0.5～3.0cm，甚至全叶感病。茎部或枝条上的病斑长度可达0.5～2.0cm，病斑散生，形状不规则。典型症状是坏死的组织后期布满灰色霉层，此为病菌的分生孢子。当灰霉遍及整株苗木时，用手指轻轻敲打病株，即有灰色烟雾的分生孢子云出现。
灰霉病的早期症状因受害部位不同而略有差异。叶片受害通常出现两类病斑：非扩展性病斑和扩展性病斑。非扩展性病斑多在空气干燥时发生于外层叶片上，病斑呈针头状的褐色小点或绿色小圆斑，病斑扩展慢或不扩展，病部不产生灰色霉层。扩展性病斑多在空气潮湿时发生于幼嫩的叶片上，病斑初为水渍状小点，随后迅速扩展成灰色大斑，成为边缘褐色的近圆形至椭圆形病斑，或发展成叶枯，病部常有大量的分生孢子。
顶芽受病菌侵染，先呈水渍状腐烂，然后失水干枯。严重时，病害常由顶芽向枝梢蔓延，形成枯梢，其上布满灰色霉层。幼茎受害，初生暗绿色水渍状条斑，后变褐色，凹陷，枝茎变软腐烂，植株往往易折倒。早春幼苗遇害则常出现猝倒症状。