1.种前深翻土壤;与非伞型花科和非茄科蔬菜实行轮作。2.合理浇水,并注意雨后排水;施用充分腐熟的农家肥;及时防治地下害虫。3.及早拔除病株,收获后彻底清理病残体,带到田外集中销毁。芹菜根腐病可用甲霜噁霉灵与甲基托布津混喷根部进行防治。氢氧化铜和硫酸铜是细菌性软腐病的好药剂，苯醚甲环唑和阿米妙收治、有机铜芹菜根腐病效果不错。发病初期用鑫科植保黄叶死苗120稀释300-500倍液，或鑫科植保菌乐邦稀释150倍液，每隔5～7天防治1次，视病情连续防治2～3次。
