本病在临床上与羊快疫、肠毒血症等极其类似。病程十分急促，绝大多数情况是未见有病而突然发生死亡。少数病例病程稍长，可拖延1~2d，但没有超过3d的。病畜掉群，不食，呼吸困难，体温41.5ºC左右，呈昏睡俯卧，并保持在这种状态下毫无痛苦地突然死去。病羊尸体皮下静脉显著淤血，使羊皮呈暗黑色外观(黑疫之名．由此而来)。真胃幽门部、小肠粘膜充血、出血。肝脏表面和深层有数目不等的凝固性坏死灶，呈灰黑色不整圆形，周围有一鲜红色充血带围绕，坏死灶直径可达2～3厘米，切面呈半月形。羊黑疫肝脏的这种坏死变化具有重要诊断意义(这种病变与未成熟肝片吸虫通过肝脏时所造成的病变不同，后者为黄绿色、弯曲似虫样的带状病痕)。体腔多有积液。心内膜常见有出血点。病羊尸体皮下静脉显着充血，其皮肤呈暗黑色外观。胸部皮下组织经常水肿。浆膜腔有液体渗出，暴露于空气易于凝固，液体常呈黄色，但腹腔液略带血色。左心室心内膜下常出血。