羊发生硒中毒的病理表现为急性中毒和亚急性及慢性中毒两种情况。急性中毒时，动物全身出血，肺充血、水肿，腹水增多，肝、肾发生变性，气管内充满大量白色泡沫状液体。亚急性及慢性中毒时，主要病变见于肝脏、肾脏、心脏、脾脏、肺脏、淋巴结、胰脏和大脑，表现为肝脏萎缩、坏死或硬化，脾肿大并有局灶性出血，脑水肿、软化等。病理组织学检查显示组织细胞变性、坏死，细胞核扩张、充血，细支气管扩张、充满大量红色均染物质。心肌变性，肝脏中央静脉与肝窦隙扩张，甚至破裂、出血，并出现局灶性坏死。肾脏常见肾小球毛细血管扩张、充血，部分胞核增生、深染，肾小管上皮变性坏死。剖检发现肺充血、水肿，肝脏充血、坏死，心外膜有出血点。亚急性肝脏变性、坏死、硬化，脾脏肿大、灶状出血，常有腹水，脑充血、出血、水肿。慢性主要表现营养不良和贫血，腹腔有多量淡红色液体，心肌萎缩，心脏扩张，肝硬变和萎缩，肾小球肾炎。