牛病毒性腹泻的典型症状包括发热、腹泻、黏膜损伤和脚部损伤。这些症状通常用于诊断。然而，实际上许多牛处于轻微感染状态，并不表现出典型的病毒性腹泻症状。在检测时，通常只检查牛的口腔黏膜病变和脚趾部损伤。但这些症状主要见于反复或持续性感染的牛，急性感染的牛往往不明显。
在高热持续2至3天后，部分幼犊会出现双相热型。腹泻表现为水样，粪便带恶臭并含有黏液或血液。牛还会大量流涎、流泪，口腔和鼻黏膜出现糜烂或溃疡，严重时整个口腔会覆盖灰白色坏死上皮，像煮熟一样。孕牛可能流产，犊牛可能出现小脑发育不全、失明等先天缺陷。
慢性型病例较少见，病程可从两个月到一年。病畜消瘦，持续或间歇性腹泻，里急后重，粪便带血或黏膜。鼻镜糜烂，但口腔内少有糜烂。蹄叶发炎及趾间皮肤糜烂坏死导致病畜跛行。
