成年牛的真胃溃疡通常发生在胃底部，而喂奶的犊牛溃疡常发生于幽门窦处。采食后，溃疡处的血管会变得非常明显，坏死组织可以从出血性溃疡灶脱落。大多数穿孔的病例不会造成网膜穿孔，从而形成直径12～15cm的凹陷，凹陷内含有瘀血和坏死组织碎片。凹陷内的物质可广泛浸入网膜的脂肪组织，溃疡与附近的组织器官或真胃壁之间可发生粘连。
溃疡底部由内向外分四层：炎性渗出层、坏死组织层、肉芽组织层、瘢痕层，瘢痕底部小动脉因炎症刺激常有增殖性动脉内膜炎，小动脉管壁增厚。
