霉菌素会导致母猪肝脏受损，免疫力、抵抗力下降，生长发育受阻，生产性能降低，出现中毒性流产、死胎、产弱仔等现象。此外，霉菌毒素还会对母猪的消化系统造成危害，饲料内的毒素超标会刺激胃壁，引起胃壁发炎、溃疡，最终可能导致胃穿孔。饲喂被黄曲霉毒素污染的日粮会加剧维生素A和维生素E的缺乏，降低猪的免疫性能，导致疫病发生，如流产、死胎及衣原体、蓝耳病等。霉菌毒素还可能造成母猪肝胆器官损伤、抗病能力下降、生长发育停滞、采食量减少等危害，且还会出现不育、流产、死胎、假发情等繁殖障碍，导致猪饲料中的饲料营养价值降低，给养殖场带来很大的养殖损失。可导致动物生长缓慢，饲料转化率低。