除口腔和蹄部病变外，还可见到食道和瘤胃粘膜有水疱和烂斑；胃肠有出血性炎症；肺呈浆液性浸润；心包内有大量混浊而粘稠的液体。恶性口蹄疫可在心肌切面上见到灰白色或淡黄色条纹与正常心肌相伴而行，如同虎皮状斑纹，俗称虎斑心。
病猪蹄冠、蹄叉、蹄踵、鼻吻、口腔粘膜、上腭、齿龈、舌等部位出现米粒至蚕豆大小的水疱，水疱内充满淡黄色或灰白色微浑浊的浆液。2~3天后水疱破溃形成鲜红色糜烂斑。若无细菌感染，两周左右可结痂痊愈。当继发细菌感染时病程延长，可能导致蹄壳脱落。
