羊黑疫的主要病变见于肝脏、体腔和循环系统。病羊尸体皮下静脉显著瘀血，使其皮肤呈黑色外观，胸部皮下组织常呈水肿。体腔有液体渗出，暴露于空气易于凝固。左心室内膜下常出血。第四胃幽门部和小肠充血和出血。肝脏充血肿胀，有界限明显的坏死灶，呈灰黄色，直径能够达到2～3cm，且胆囊有所肿大，含有稀薄胆汁。肝脏内发生的坏死是诊断该病的重要依据。
