早期用喹诺酮类、乙酰甲喹、大蒜苦参注射液肌注治疗。
中后期用庆大霉素、氨苄西林钠、红霉素等配合葡萄糖、生理盐水、碳酸氢钠注射液静注。
牛的腹泻有传染性，一定是由病原微生物引起，在不明病原的情况下，不能称为牛传染性腹泻。
如临床症状有发热，粘膜发炎，糜烂，坏死等可用抗生素和磺胺类药物，同时用收敛剂和补液方法对症治疗可减少继发性细菌感染。
