火碱是一种消毒效果很好的药物。其2%~4%的溶液可杀死繁殖型细菌和病毒，10%的溶液在24小时内可杀死结核杆菌，30%的溶液在10分钟内可杀死炭疽芽孢。用温水稀释溶液效果更好，加点食盐更佳。
消毒后若着急进猪，24小时后冲洗圈舍即可上猪；若不着急，空置7-10天即可。
火碱作为常用消毒剂，可用于禽舍、饲槽、运输工具等消毒。消毒液接触二氧化碳的区域仅是表面一层，因此不易快速失效。
