引起仔猪腹泻的原因主要有以下几点：
1.母猪的乳汁质量不好，过浓或过稀或受感染后乳中带菌。
2.大肠杆菌、沙门氏菌等细菌感染引起仔猪腹泻，可用抗生素治疗。
3.轮状病毒和冠状病毒感染导致仔猪腹泻，但无有效药物治疗，抗生素只能防止继发感染。
4.植物性饲料，如其中含有豆粕，可使仔猪肠道致敏，所以乳猪料中应含有除豆粕外的优质蛋白质原料。另外，应早日进行仔猪补料，让其消化道适应植物性饲料的变化。
5.产仔舍内卫生条件差，潮湿、温度变化大，小环境条件恶劣等也可引起仔猪腹泻。
6.母猪便秘、母猪不做大肠杆菌疫苗、仔猪断尾、剪牙消毒不彻底和不规范、产房保温措施不好以及湿度过大。
7.母猪产后三联症的影响。